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  • mekali


    retraité, diplôme d'études approfondies en génétique fondamentale UPMC 1973, recherche de 1974 à 1978 à Orsay université Paris-Sud sous la direction du professeur Jean-Luc Rossignol.

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      Luisi Emergence of life 2016
      11.3.20 Tanger La perméabilité des liposomes, p. 317 296 et les pores dans la phase cubique, p. 281, revew 2015 Le métabolisme prébiotique et l'overcrowding: p 396 Construire à partir du toit: p.55 fischer...

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      Un délire d'ADN: la création de gènes
      21.8.19 Paris Voir Un délire d'ADN: Le labyrinthe 16.9.19 Paris Je vais lister les idées qui ont émergées depuis l'étude des tRNAs. Cela ne sera pas dans l'ordre ni définitif, mais c'est pour fixer ...

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      Un délire d'ADN et les PEEMOVs
      21.9.19 Paris Voir Un délire d'ADN: Le labyrinthe 02.10.19 Paris Voir la rédaction du 16.9.19 dans création de gènes Séparation des églises et de l'état: Par ce mnémotechnique je ...

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      Un délire d'ADN: Le cheminement
      21.9.18 Paris Voir Un délire d'ADN: Le labyrinthe 24.8.19 Paris I. L'article sur les grands opérons des bactéries dont un contient 21 gènes de tRNAs différents: tRNA gene structures in bacteria (B.M. ...

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      Un délire d'ADN: Le labyrinthe
      21.8.19 Paris Un délire d'ADN ou la création des gènes. A partir des annotations de NCBI chez les bactéries, j'ai recensé les opérons puis les clusters 16s-aas-CDS-23s-5s-aas. Avec les opéron...

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      Journal intime de la réflexion
      30.12.18 Paris Par réflexion j'entends ma réflexion sur les PEEMOVs que j'ai entreprise déjà depuis 10 ans. Avec les articles sur la répétition des bases et la corrélation entre les...

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      Le potentiel électrique à l'image des cumulo-nimbus
      23.9.17 TangerC'est en repensant la membrane prébiotique lors des échanges avec Mr Moonens ( voit mail) qu'il m'est apparu naïf de penser que les protons H+ puissent se concentrer dans le périplasme, car localement...

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      Les gènes des tRNAs
      23.9.17 Tanger Comparer l'information et la fonction de ces gènes à ceux des gènes protéiques. Alors que pour les gènes protéiques il est nécessaire de passer par une traduction de l'informat...

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      Le stress enzymatique
      26.8.17 Tanger La fonction enzymatique est constitutive de l'architecture biologique même et la rendre stressante n'aurait de sens que si on dévoile son caractère nocif au moins relativement. Ce caractère nocif re...

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      Un polypeptide à un seul acide aminé
      11.8.17 Paris Il y a une contradiction dans ce titre et c'est voulu. L'idée est venue à la suite de l'étude des tRNAs: Un tRNA correspondrait à un gène protéique avec les extrémités 3'...

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      La tectonique des plasmides
      20.4.17 Paris Cette idée est née de l'étude des corrélations entre les codons dans les gènes de protéines des bactéries. L'article s'étend à toutes protéines, celles...

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      La molécule cristalline
      Paris 13.02.17 La molécule cristalline ou plutôt l'état cristallin d'une molécule en comparaison avec son état vibratoire. L'état cristallin d'une molécule est son état vibratoire en de...

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      Répétition des bases A et T dans l'ADN des bactériesRépétition des bases G et C dans l'ADN des bactériesRépétition des bases A et T dans l'ADN des cyanobactériesRépétition des bases G et C dans l'ADN des cyanobactériesRépétition des bases A et T dans l'ADN des archées
      Les répétitions des bases dans l'ADN des procaryotes
      Paris le 12.01.17 Article dans wikipédia Paris le 8.9.16 Précision sur le titre Il s'agit des répétitions de la même base et de leurs longueurs dans le génome entier d'un procaryote donné. E...

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      Concept dynamique/statique
      21.9.16 Paris J'allais le titrer périplasme prébiotique. C'est en effet une réflexion qui n'est pas aboutie, voir la note du 28.5.14 dans  concept global 2014, dans préparation. Mais ma réflexion sur ...

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      Perl %GC gène
      06.07.16  Tanger   # Les noms des organismes (@noms) sont ceux de KEGG. Les protéines sont extraits de KEGG au format 60 caractères, mises chacune dans un fichier txt (sans le .txt) dont le nom est sous la form...

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      Références
      23.5.16 Paris Il s'agit dans un premier temps d'accumuler des références au fur et à mesure de leur rencontre, et de les classer par thèmes.

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      Résultats et discussion
      23.5.16  Paris Résultats Le diagramme de chaque codon et aa, Le classement des codons et aa suivant les valeurs propres des matrices des corrélations Statistiques de la répétition des bases Discussion GC ...

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      Marériel et méthodes
      23.5.16  Paris Le choix des bactéries, Les bases de données utilisées, Les moulinettes en Perl pour la compilation et Les types de compilations choisis, Les protéines à étudier, Les diagra...

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      Revue du GC content dans la littérature
      23.5.16  Paris Beaucoup de travaux ont été faits sur le contenu en GC de l'ADN depuis les années 1950. L'aspect physique de l'ADN y est abordé mais pas du point de vue résonance comme je l'ai fait dan...

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      Du concept global au GC content
      23.5.16 Paris Comment je suis arrivé à étudier le contenu en GC de l'ADN dans ma réflexion sur les origines de la vie. Cela sera l'introduction et la définition du cadre de l'article à publier sous ...

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      Les états vibratoires de l'ADN et la sélection naturelle
      27.3.16  Paris                                     ...

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      Perl codons: m protéines n organismes
      27.02.16  Paris ##               Perl pour compter les codons d'un ensemble de protéines pour plusieurs organismes.## Les noms des organismes (@noms) sont ceu...

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      Perl répétition des bases: chromosome
      17.11.15  Paris Programme en perl pour compter les bases répétées #!/usr/local/bin/perl            mekki 17.11.15            ...

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      Perl répétitions des bases: aléas.
      27.02.16  Paris #   Comptage, par aléa, des répétitions de bases pour un %GC donné.# 3 paramètres à changer ici sur la 1ère ligne et sauvegarder avant d'exécuter le prog...

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      Les états vibratoires de l'ADN et la sélection naturelle: tableaux
      24.02.16  Paris Tableaux faits avec le programme "Perl codons: m protéines n organismes" . 1.    Tableau 1 : codon-usages    des DNA, RNA polymérases et des Aminoacyl-tRNA synthetases &n...

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      Chronologie des écrits
      Mise en ligne ce jour 3.2.16  Paris Chronologie des écrits dans blogooolife Par date                          Par dossier ordre dates   d&ea...

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      Le concept du tout ou rien
      23.01.16  Paris Ce concept vient comblé un vide qui me tracassait pour le principe de continuité qui est à la base de ma réflexion sur l'évolution moléculaire, ou évolution prébio...

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      Séquences ADN
      18.11.15  Paris   Prépation pour les séquences de type ** xddz ** avec x et z différents de d (d pour double): exemple ATTG. Pour une base donnée il y a ainsi 10 séquences. Les séquences d...

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      Thermodynamique prébiotique II
      5.9.15  Paris Intro:      Thermo/biotique .....autres  ( voir Thermodynaique prébiotique  Tanger 8.8.15 ) Objet:     Liposome dans poche de pétrole   &minu...

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